更新されるというか、
TrueNAS CORE であえなく
freenas_defaultという自己署名証明書
の有効期限が切れてしまった環境でも、
TrueNAS SCALE にアップグレードするだけで、
新しい有効期限の
truenas_defaultという自己署名証明書
が作成されます。
のでもう TrueNAS CORE では修正されることはないんじゃないかと。
Certificate 'freenas_default' has expired. （未解決）
なお、古い freenas_default の自己署名証明書の方は手動で削除すれば Alert の通知もなくなります。
右のごみ箱アイコンから削除できます。