いまさらですが、8月末にFreeNASの9.3.1がひっそりとリリースされています。
（特にNewsにもアナウンスされず）
FreeNAS 9.3.1 is now released! | FreeNAS Community
によると、特別な区切りではなく、 STABLE TRAIN や http://download.freenas.org/latest などで確認できるらしいです。
ので 9.3.1 になったから何がどう、という変更はなさそうです。
（9.3.1のフォルダに20150825というフォルダからできています）
System Information の Build のところも
FreeNAS-9.3-STABLE-XXXXXXXX
のままです。